Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SARM1Q6SZW1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SARM1Q6SZW1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SARM1Q6SZW1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms