Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOA5Q6Q788 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOA5Q6Q788 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOA5Q6Q788 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOA5Q6Q788 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOA5Q6Q788 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOA5Q6Q788 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOA5Q6Q788 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
APOA5Q6Q788 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOA5Q6Q788 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOA5Q6Q788 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms