Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG6

BRAT1, BRCA1-associated ATM activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAT1Q6PJG6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRAT1Q6PJG6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAT1Q6PJG6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAT1Q6PJG6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms