Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGP8Q6NSW7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGP8Q6NSW7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NANOGP8Q6NSW7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NANOGP8Q6NSW7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms