Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf57Q5W0N0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf57Q5W0N0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf57Q5W0N0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf57Q5W0N0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms