Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM236Q5W0B7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM236Q5W0B7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM236Q5W0B7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms