Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARMC3Q5W041 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARMC3Q5W041 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARMC3Q5W041 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARMC3Q5W041 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARMC3Q5W041 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARMC3Q5W041 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARMC3Q5W041 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARMC3Q5W041 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARMC3Q5W041 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARMC3Q5W041 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARMC3Q5W041 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARMC3Q5W041 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARMC3Q5W041 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARMC3Q5W041 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARMC3Q5W041 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms