Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND4CQ5VZ89 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND4CQ5VZ89 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND4CQ5VZ89 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms