Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms