Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIF1Q5UIP0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIF1Q5UIP0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIF1Q5UIP0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms