Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP58Q5T655 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP58Q5T655 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms