Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWT1Q5T5J6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWT1Q5T5J6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWT1Q5T5J6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWT1Q5T5J6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWT1Q5T5J6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWT1Q5T5J6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SWT1Q5T5J6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SWT1Q5T5J6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SWT1Q5T5J6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SWT1Q5T5J6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SWT1Q5T5J6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SWT1Q5T5J6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SWT1Q5T5J6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SWT1Q5T5J6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.5 ms