Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4I8

C6orf52, Putative uncharacterized protein C6orf52, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf52Q5T4I8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf52Q5T4I8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf52Q5T4I8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms