Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM47AQ5JRC9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM47AQ5JRC9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM47AQ5JRC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM47AQ5JRC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM47AQ5JRC9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM47AQ5JRC9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM47AQ5JRC9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM47AQ5JRC9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM47AQ5JRC9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM47AQ5JRC9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM47AQ5JRC9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM47AQ5JRC9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM47AQ5JRC9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM47AQ5JRC9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM47AQ5JRC9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms