Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A13Q5J8X5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A13Q5J8X5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms