Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC4Q5GLZ8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms