Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGO2Q562F6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGO2Q562F6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms