Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC23Q53EV4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC23Q53EV4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC23Q53EV4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms