Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC58Q4VC31 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC58Q4VC31 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC58Q4VC31 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC58Q4VC31 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC58Q4VC31 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC58Q4VC31 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC58Q4VC31 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC58Q4VC31 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC58Q4VC31 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC58Q4VC31 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC58Q4VC31 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC58Q4VC31 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC58Q4VC31 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC58Q4VC31 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC58Q4VC31 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms