Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms