Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP100Q494V2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP100Q494V2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms