Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SP6Q3SY56 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms