Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LONRF1Q17RB8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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