Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
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PTPROQ16827 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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PTPROQ16827 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPROQ16827 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
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PTPROQ16827 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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PTPROQ16827 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPROQ16827 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
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