Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN1Q16799 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTN1Q16799 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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