Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFIL3Q16649 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIL3Q16649 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFIL3Q16649 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms