Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF239Q16600 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF239Q16600 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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