Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PKN1Q16512 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PKN1Q16512 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKN1Q16512 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
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