Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR6A1Q15406 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR6A1Q15406 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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