Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCM1Q15154 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PCM1Q15154 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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PCM1Q15154 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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