Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NCAPD2Q15021 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NCAPD2Q15021 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms