Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB33AQ14088 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB33AQ14088 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB33AQ14088 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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