Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAPGEF1Q13905 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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