Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX39BQ13838 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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