Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.07■■■□□ 2.41
HDAC1Q13547 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
HDAC1Q13547 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDAC1Q13547 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC1Q13547 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
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