Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SF3B2Q13435 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
SF3B2Q13435 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SF3B2Q13435 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms