Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PDE3BQ13370 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PDE3BQ13370 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDE3BQ13370 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
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