Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP3B2Q13367 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP3B2Q13367 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP3B2Q13367 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3B2Q13367 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP3B2Q13367 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms