Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.353e-6■■■□□ 16.7
SRSF9Q13242 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-6■■■□□ 16.7
SRSF9Q13242 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.222e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 HEXDC-211ENST00000582315 873 ntTSL 515.02■□□□□ -02e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 HEXDC-212ENST00000582429 1824 ntTSL 214.08□□□□□ -0.152e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 AMDHD2-212ENST00000566706 940 ntTSL 513.83□□□□□ -0.22e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 AMDHD2-211ENST00000565963 844 ntTSL 512.89□□□□□ -0.352e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 AMDHD2-214ENST00000567475 714 ntTSL 212.7□□□□□ -0.382e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 AMDHD2-209ENST00000563633 1117 ntTSL 512.69□□□□□ -0.382e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 HEXDC-207ENST00000578775 779 ntTSL 312.56□□□□□ -0.42e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 AMDHD2-208ENST00000563556 490 ntTSL 412.14□□□□□ -0.472e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 AMDHD2-217ENST00000569879 924 ntTSL 312.14□□□□□ -0.472e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 AMDHD2-215ENST00000568263 1482 ntTSL 211.11□□□□□ -0.632e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 AMDHD2-216ENST00000569219 735 ntTSL 210.9□□□□□ -0.662e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 HEXDC-204ENST00000578130 853 ntTSL 210.44□□□□□ -0.742e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.742e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.932e-9■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 SPG7-217ENST00000568151 544 ntTSL 414.05□□□□□ -0.161e-7■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 SPG7-214ENST00000566371 581 ntTSL 313.34□□□□□ -0.271e-7■■■□□ 16.6
SRSF9Q13242 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.434e-6■■■□□ 16.5
SRSF9Q13242 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 212.61□□□□□ -0.394e-9■■■□□ 16.5
SRSF9Q13242 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 26.12□□□□□ -1.434e-9■■■□□ 16.5
SRSF9Q13242 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.044e-9■■■□□ 16.5
SRSF9Q13242 ACSM3-203ENST00000501740 839 ntTSL 58.7□□□□□ -1.021e-6■■■□□ 16.5
SRSF9Q13242 ACSM3-213ENST00000568235 558 ntTSL 47.51□□□□□ -1.211e-6■■■□□ 16.5
SRSF9Q13242 ACSM3-205ENST00000561584 561 ntTSL 47.27□□□□□ -1.251e-6■■■□□ 16.5
SRSF9Q13242 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.352e-6■■■□□ 16.5
SRSF9Q13242 RABL6-210ENST00000484471 2746 ntTSL 515.17■□□□□ 0.022e-6■■■□□ 16.5
SRSF9Q13242 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 16.5
SRSF9Q13242 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.212e-6■■■□□ 16.5
SRSF9Q13242 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.292e-6■■■□□ 16.5
SRSF9Q13242 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 16.4
SRSF9Q13242 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.371e-6■■■□□ 16.4
SRSF9Q13242 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.671e-6■■■□□ 16.4
SRSF9Q13242 TAF15-210ENST00000604694 891 ntTSL 510.51□□□□□ -0.731e-6■■■□□ 16.4
SRSF9Q13242 BCAR1-213ENST00000563323 558 ntTSL 312.68□□□□□ -0.386e-11■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.416e-11■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.486e-11■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.496e-11■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 BCAR1-211ENST00000562556 4659 ntTSL 211.35□□□□□ -0.596e-11■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.676e-11■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC10.39□□□□□ -0.756e-11■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.816e-11■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 BCAR1-220ENST00000568864 556 ntTSL 48.99□□□□□ -0.976e-11■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.14e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.054e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.232e-6■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.252e-6■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.262e-6■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 FAM193B-208ENST00000506955 4604 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.314e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 FAM193B-219ENST00000524677 1916 ntTSL 212.66□□□□□ -0.384e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 FAM193B-204ENST00000505569 1870 ntTSL 1 (best)12.32□□□□□ -0.444e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.454e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 FBXO17-203ENST00000596025 935 ntTSL 212.23□□□□□ -0.454e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 PDXK-212ENST00000470029 583 ntTSL 312.02□□□□□ -0.494e-6■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 FAM193B-212ENST00000510163 2237 ntTSL 1 (best)11.99□□□□□ -0.494e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 FBXO17-205ENST00000599418 2222 ntTSL 211.93□□□□□ -0.54e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 FAM193B-216ENST00000513502 705 ntTSL 211.52□□□□□ -0.574e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-207ENST00000578134 831 ntTSL 311.01□□□□□ -0.653e-13■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.714e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 FBXO17-207ENST00000601394 2366 ntTSL 510.54□□□□□ -0.724e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 FAM193B-214ENST00000510479 2800 ntTSL 29.16□□□□□ -0.944e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 FBXO17-206ENST00000599598 510 ntTSL 58.91□□□□□ -0.984e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 FBXO17-204ENST00000597696 932 ntTSL 28.54□□□□□ -1.044e-9■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.22e-6■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-204ENST00000577664 568 ntTSL 47□□□□□ -1.293e-13■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-208ENST00000578525 564 ntTSL 46.77□□□□□ -1.333e-13■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-227ENST00000583352 901 ntTSL 36.28□□□□□ -1.43e-13■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.114e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.154e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.244e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.274e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-225ENST00000556513 1403 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.274e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-231ENST00000557336 580 ntTSL 36.94□□□□□ -1.34e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-214ENST00000554969 1924 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.324e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-219ENST00000555309 1714 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.334e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.344e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-230ENST00000557201 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.344e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.364e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-213ENST00000554891 644 ntTSL 56.56□□□□□ -1.364e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-232ENST00000557442 1308 ntTSL 26.48□□□□□ -1.374e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-223ENST00000556142 1599 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.384e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.44e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-218ENST00000555215 781 ntTSL 56.26□□□□□ -1.414e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-209ENST00000554383 1039 ntTSL 56.26□□□□□ -1.414e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-224ENST00000556226 629 ntTSL 56.07□□□□□ -1.444e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-216ENST00000555137 789 ntTSL 35.98□□□□□ -1.454e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-207ENST00000553614 604 ntTSL 55.6□□□□□ -1.514e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.514e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-212ENST00000554539 748 ntTSL 55.28□□□□□ -1.564e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.654e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-233ENST00000557768 599 ntTSL 34.24□□□□□ -1.734e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.964e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPC-217ENST00000555176 531 ntTSL 52.66□□□□□ -1.984e-16■■■□□ 16.3
SRSF9Q13242 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.678e-7■■■□□ 16.2
SRSF9Q13242 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.818e-7■■■□□ 16.2
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