Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 BUD9YGR041W 1644 nt5.35□□□□□ -1.55
USB1Q12208 RVB2YPL235W 1416 nt5.35□□□□□ -1.55
USB1Q12208 GLC8YMR311C 690 nt5.35□□□□□ -1.55
USB1Q12208 SDH4YDR178W 546 nt5.34□□□□□ -1.55
USB1Q12208 YGL235WYGL235W 537 nt5.34□□□□□ -1.55
USB1Q12208 MSP1YGR028W 1089 nt5.34□□□□□ -1.55
USB1Q12208 SPG1YGR236C 288 nt5.34□□□□□ -1.55
USB1Q12208 IMD1YAR073W 1212 nt5.34□□□□□ -1.55
USB1Q12208 IME2YJL106W 1938 nt5.34□□□□□ -1.55
USB1Q12208 NHA1YLR138W 2958 nt5.34□□□□□ -1.56
USB1Q12208 OPT1YJL212C 2400 nt5.33□□□□□ -1.56
USB1Q12208 YIL055CYIL055C 1884 nt5.33□□□□□ -1.56
USB1Q12208 GEF1YJR040W 2340 nt5.33□□□□□ -1.56
USB1Q12208 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.33□□□□□ -1.56
USB1Q12208 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.33□□□□□ -1.56
USB1Q12208 ICS3YJL077C 396 nt5.33□□□□□ -1.56
USB1Q12208 YUR1YJL139C 1287 nt5.33□□□□□ -1.56
USB1Q12208 DUS4YLR405W 1104 nt5.33□□□□□ -1.56
USB1Q12208 YLR463CYLR463C 552 nt5.33□□□□□ -1.56
USB1Q12208 TSR3YOR006C 942 nt5.33□□□□□ -1.56
USB1Q12208 RDL2YOR286W 450 nt5.33□□□□□ -1.56
USB1Q12208 CWC27YPL064C 906 nt5.33□□□□□ -1.56
USB1Q12208 MCH1YDL054C 1461 nt5.32□□□□□ -1.56
USB1Q12208 ERG1YGR175C 1491 nt5.32□□□□□ -1.56
USB1Q12208 YPR196WYPR196W 1413 nt5.32□□□□□ -1.56
USB1Q12208 CHL4YDR254W 1377 nt5.32□□□□□ -1.56
USB1Q12208 PAT1YCR077C 2391 nt5.32□□□□□ -1.56
USB1Q12208 ECM14YHR132C 1293 nt5.32□□□□□ -1.56
USB1Q12208 VPS24YKL041W 675 nt5.32□□□□□ -1.56
USB1Q12208 STE13YOR219C 2796 nt5.32□□□□□ -1.56
USB1Q12208 CEF1YMR213W 1773 nt5.32□□□□□ -1.56
USB1Q12208 ISC1YER019W 1434 nt5.31□□□□□ -1.56
USB1Q12208 SET5YHR207C 1581 nt5.31□□□□□ -1.56
USB1Q12208 QNS1YHR074W 2145 nt5.31□□□□□ -1.56
USB1Q12208 BCY1YIL033C 1251 nt5.31□□□□□ -1.56
USB1Q12208 LDS1YAL018C 978 nt5.31□□□□□ -1.56
USB1Q12208 YML018CYML018C 1182 nt5.31□□□□□ -1.56
USB1Q12208 MRPL10YNL284C 969 nt5.31□□□□□ -1.56
USB1Q12208 TFC6YDR362C 2019 nt5.31□□□□□ -1.56
USB1Q12208 CRZ1YNL027W 2037 nt5.31□□□□□ -1.56
USB1Q12208 EIS1YMR031C 2532 nt5.31□□□□□ -1.56
USB1Q12208 COA1YIL157C 594 nt5.3□□□□□ -1.56
USB1Q12208 PSR2YLR019W 1194 nt5.3□□□□□ -1.56
USB1Q12208 SAC6YDR129C 1929 nt5.3□□□□□ -1.56
USB1Q12208 SRP101YDR292C 1866 nt5.3□□□□□ -1.56
USB1Q12208 GEX1YCL073C 1848 nt5.3□□□□□ -1.56
USB1Q12208 GPI11YDR302W 660 nt5.29□□□□□ -1.56
USB1Q12208 RNH201YNL072W 924 nt5.29□□□□□ -1.56
USB1Q12208 RRS1YOR294W 612 nt5.29□□□□□ -1.56
USB1Q12208 TFB4YPR056W 1017 nt5.29□□□□□ -1.56
USB1Q12208 YBR124WYBR124W 360 nt5.29□□□□□ -1.56
USB1Q12208 GUP2YPL189W 1830 nt5.29□□□□□ -1.56
USB1Q12208 YDR278CYDR278C 318 nt5.28□□□□□ -1.56
USB1Q12208 HVG1YER039C 750 nt5.28□□□□□ -1.56
USB1Q12208 TMT1YER175C 900 nt5.28□□□□□ -1.56
USB1Q12208 SSK1YLR006C 2139 nt5.28□□□□□ -1.56
USB1Q12208 YMR295CYMR295C 594 nt5.28□□□□□ -1.56
USB1Q12208 FSF1YOR271C 984 nt5.28□□□□□ -1.56
USB1Q12208 IFA38YBR159W 1044 nt5.28□□□□□ -1.56
USB1Q12208 YOL036WYOL036W 2286 nt5.28□□□□□ -1.56
USB1Q12208 AFG1YEL052W 1530 nt5.28□□□□□ -1.56
USB1Q12208 YDR387CYDR387C 1668 nt5.28□□□□□ -1.56
USB1Q12208 GEX2YKR106W 1848 nt5.27□□□□□ -1.57
USB1Q12208 MAK31YCR020C-A 267 nt5.27□□□□□ -1.57
USB1Q12208 TIM22YDL217C 624 nt5.27□□□□□ -1.57
USB1Q12208 MRS1YIR021W 1092 nt5.27□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.27□□□□□ -1.57
USB1Q12208 TSA1YML028W 591 nt5.27□□□□□ -1.57
USB1Q12208 MRPS16YPL013C 366 nt5.27□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YCK1YHR135C 1617 nt5.26□□□□□ -1.57
USB1Q12208 MAK32YCR019W 1092 nt5.26□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YET3YDL072C 612 nt5.26□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YDR015CYDR015C 240 nt5.26□□□□□ -1.57
USB1Q12208 RPT3YDR394W 1287 nt5.26□□□□□ -1.57
USB1Q12208 ARA2YMR041C 1008 nt5.26□□□□□ -1.57
USB1Q12208 CAF40YNL288W 1122 nt5.26□□□□□ -1.57
USB1Q12208 RPN7YPR108W 1290 nt5.26□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YPR123CYPR123C 435 nt5.26□□□□□ -1.57
USB1Q12208 MET8YBR213W 825 nt5.26□□□□□ -1.57
USB1Q12208 WHI2YOR043W 1461 nt5.26□□□□□ -1.57
USB1Q12208 KTR5YNL029C 1569 nt5.25□□□□□ -1.57
USB1Q12208 LSG1YGL099W 1923 nt5.25□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YIR042CYIR042C 711 nt5.25□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.25□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YOL163WYOL163W 510 nt5.25□□□□□ -1.57
USB1Q12208 MRP51YPL118W 1035 nt5.25□□□□□ -1.57
USB1Q12208 HST3YOR025W 1344 nt5.24□□□□□ -1.57
USB1Q12208 PYC2YBR218C 3543 nt5.24□□□□□ -1.57
USB1Q12208 ERG7YHR072W 2196 nt5.24□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YHM2YMR241W 945 nt5.24□□□□□ -1.57
USB1Q12208 IDP3YNL009W 1263 nt5.24□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YPL041CYPL041C 624 nt5.24□□□□□ -1.57
USB1Q12208 DDC1YPL194W 1839 nt5.24□□□□□ -1.57
USB1Q12208 TPO3YPR156C 1869 nt5.24□□□□□ -1.57
USB1Q12208 PET112YBL080C 1626 nt5.23□□□□□ -1.57
USB1Q12208 PGK1YCR012W 1251 nt5.23□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YDL023CYDL023C 321 nt5.23□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YDL218WYDL218W 954 nt5.23□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YEL068CYEL068C 333 nt5.23□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YGL072CYGL072C 360 nt5.23□□□□□ -1.57
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