Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NCBP1Q09161 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCBP1Q09161 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NCBP1Q09161 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms