Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CD300CQ08708 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms