Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUDPQ08623 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUDPQ08623 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms