Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN3Q08043 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN3Q08043 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms