Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EGR3Q06889 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EGR3Q06889 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EGR3Q06889 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms