Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GABPAQ06546 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GABPAQ06546 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABPAQ06546 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABPAQ06546 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms