Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR4Q05215 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EGR4Q05215 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR4Q05215 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms