Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSBP1Q04837 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms