Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
ERCC6Q03468 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC42.33■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
ERCC6Q03468 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
ERCC6Q03468 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
ERCC6Q03468 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ERCC6Q03468 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
ERCC6Q03468 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ERCC6Q03468 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ERCC6Q03468 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
ERCC6Q03468 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
ERCC6Q03468 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
ERCC6Q03468 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
ERCC6Q03468 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ERCC6Q03468 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ERCC6Q03468 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ERCC6Q03468 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.16■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.34
ERCC6Q03468 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms