Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 CCP1YKR066C 1086 nt5.62□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 MHT1YLL062C 975 nt5.62□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YLR312CYLR312C 1197 nt5.62□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 AIM33YML087C 939 nt5.62□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 ODC2YOR222W 924 nt5.62□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 UTR2YEL040W 1404 nt5.61□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 IMD1YAR073W 1212 nt5.61□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 ARA2YMR041C 1008 nt5.61□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 MRPL23YOR150W 492 nt5.61□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 OSW2YLR054C 2175 nt5.6□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 UTP9YHR196W 1728 nt5.6□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 RCK1YGL158W 1539 nt5.6□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 EAF5YEL018W 840 nt5.6□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YPT1YFL038C 621 nt5.6□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 TFG2YGR005C 1203 nt5.6□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 FBA1YKL060C 1080 nt5.6□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YKR045CYKR045C 552 nt5.6□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YNL092WYNL092W 1203 nt5.6□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YNL194CYNL194C 906 nt5.6□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 EFT2YDR385W 2529 nt5.6□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 EFT1YOR133W 2529 nt5.6□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YEL020CYEL020C 1683 nt5.59□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 CDC1YDR182W 1476 nt5.59□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 CRP1YHR146W 1398 nt5.59□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 SUB2YDL084W 1341 nt5.59□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 FYV1YDR024W 486 nt5.59□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YRB2YIL063C 984 nt5.59□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 TAF11YML015C 1041 nt5.59□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YMR122CYMR122C 375 nt5.59□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YHK8YHR048W 1545 nt5.58□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 COQ1YBR003W 1422 nt5.58□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 GPD2YOL059W 1323 nt5.58□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 PEX7YDR142C 1128 nt5.58□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 YDR187CYDR187C 519 nt5.58□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 YIL077CYIL077C 963 nt5.58□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 CIS3YJL158C 684 nt5.58□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 MIA40YKL195W 1212 nt5.58□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 YHR020WYHR020W 2067 nt5.58□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 IMA5YJL216C 1746 nt5.57□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 CUP2YGL166W 678 nt5.57□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.57□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 YAR064WYAR064W 300 nt5.57□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 TPO3YPR156C 1869 nt5.57□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 TKL1YPR074C 2043 nt5.57□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 THI2YBR240C 1353 nt5.56□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 PTR2YKR093W 1806 nt5.56□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.56□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 YLR463CYLR463C 552 nt5.56□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 YNL228WYNL228W 777 nt5.56□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 RRP9YPR137W 1722 nt5.56□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 PPM2YOL141W 2088 nt5.55□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 COX10YPL172C 1389 nt5.55□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 GIT1YCR098C 1557 nt5.55□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 ICS3YJL077C 396 nt5.55□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 KRE9YJL174W 831 nt5.55□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 TDH2YJR009C 999 nt5.55□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 DID2YKR035W-A 615 nt5.55□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 ELC1YPL046C 300 nt5.55□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 TAE1YBR261C 699 nt5.55□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 MKC7YDR144C 1791 nt5.55□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 ACS1YAL054C 2142 nt5.54□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 UIP5YKR044W 1332 nt5.54□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 GPT2YKR067W 2232 nt5.54□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 MSY1YPL097W 1479 nt5.54□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 SQT1YIR012W 1296 nt5.54□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 YLR123CYLR123C 330 nt5.54□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 DUS4YLR405W 1104 nt5.54□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 YML6YML025C 861 nt5.54□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 YNL108CYNL108C 813 nt5.54□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 CTF19YPL018W 1110 nt5.54□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 FET3YMR058W 1911 nt5.54□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 CCT8YJL008C 1707 nt5.54□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 YML018CYML018C 1182 nt5.53□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 MOD5YOR274W 1287 nt5.53□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 STB5YHR178W 2232 nt5.53□□□□□ -1.52
SKO1Q02100 SRG1SRG1 551 nt5.52□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 VMA3YEL027W 483 nt5.52□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 MSP1YGR028W 1089 nt5.52□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 RPP1YHR062C 882 nt5.52□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 ZWF1YNL241C 1518 nt5.52□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 AVO1YOL078W 3531 nt5.52□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 BSC5YNR069C 1470 nt5.51□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 SET5YHR207C 1581 nt5.51□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 EDE1YBL047C 4146 nt5.51□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 OCA1YNL099C 717 nt5.51□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 YNL120CYNL120C 486 nt5.51□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 RFC4YOL094C 972 nt5.51□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 CWC27YPL064C 906 nt5.51□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 PDB1YBR221C 1101 nt5.51□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 SGF29YCL010C 780 nt5.51□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 GLE1YDL207W 1617 nt5.51□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 YIL055CYIL055C 1884 nt5.51□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 YDR387CYDR387C 1668 nt5.5□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 FAL1YDR021W 1200 nt5.5□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 PPM1YDR435C 987 nt5.5□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 ATG36YJL185C 882 nt5.5□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 SCS7YMR272C 1155 nt5.5□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 MSO1YNR049C 633 nt5.5□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 TEL2YGR099W 2067 nt5.5□□□□□ -1.53
SKO1Q02100 RMD9YGL107C 1941 nt5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.1 ms